O Programa Educativo da Escola Ciência Viva proporciona a todos os estudantes que a frequentam atividades de aprendizagem de acordo com periodicidade, calendário e horário definidos com os contributos dos Agrupamentos de Escolas parceiros. A Escola Ciência Viva oferece, de forma regular, espaços de interação pessoal entre estudantes, docentes, profissionais de ciência e tecnologia e equipa do Pavilhão do Conhecimento, sob a forma de ações ou iniciativas organizados para o efeito.
Neste ambiente inspirador, a curiosidade assume o papel principal e a aprendizagem faz‑se através da experimentação, da observação e do fazer. O Programa Educativo aposta na diversidade de contextos educativos — laboratórios, exposições, espaços exteriores — para proporcionar uma visão mais ampla e integrada da ciência no quotidiano. Um dos momentos mais marcantes é o Encontro com o Cientista , que permite o contacto direto com investigadores, aproximando os alunos do mundo real da investigação. Assim, cada participante vive a ciência como uma aventura, desenvolve competências essenciais e descobre o prazer de aprender explorando. Os estudantes passam uma semana no Pavilhão do Conhecimento , sem ir à sua escola, e os seus dias são passados realizando atividades de forte carácter experimental .
Incluindo elementos do currÃculo de educação formal, abordados num contexto experimental com metodologias inovadoras de aprendizagem, e em contacto regular com instituições de investigação cientÃfica e de ensino superior, o Programa disponibiliza semanas temáticas.